100%は、車が勝手に止める上限ポイントではないのですか？

非常に正確に何の100%なのかは知りませんが、アプリやダッシュボードに表示される%の話です。その数字に関して、普段の充電は80-90%までにしろ、バッテリが痛むので100%まで充電するのは長距離を走る直前だけにしろとマニュアルにあります。