Acho que as ciências básicas em geral, não (incluindo humanidades, claro)? As escolas de Física e Química do interior tinham excelentes resultados em pesquisa na minha época (12 ou 13 anos atrás quando eu ainda achava que ia dar conta de ser pesquisador).

Mas eu concordo que tem áreas em que eu simplesmente não sei de onde vem a noção de que a USP é boa (cof cof FEA cof cof cof).